Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y679

AUP1, Ancient ubiquitous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1Q9Y679 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AUP1Q9Y679 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AUP1Q9Y679 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AUP1Q9Y679 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AUP1Q9Y679 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AUP1Q9Y679 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
AUP1Q9Y679 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AUP1Q9Y679 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AUP1Q9Y679 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AUP1Q9Y679 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AUP1Q9Y679 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AUP1Q9Y679 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AUP1Q9Y679 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AUP1Q9Y679 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AUP1Q9Y679 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AUP1Q9Y679 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AUP1Q9Y679 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AUP1Q9Y679 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
AUP1Q9Y679 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AUP1Q9Y679 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
AUP1Q9Y679 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AUP1Q9Y679 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AUP1Q9Y679 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AUP1Q9Y679 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AUP1Q9Y679 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AUP1Q9Y679 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AUP1Q9Y679 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AUP1Q9Y679 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AUP1Q9Y679 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AUP1Q9Y679 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AUP1Q9Y679 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AUP1Q9Y679 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AUP1Q9Y679 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AUP1Q9Y679 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AUP1Q9Y679 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AUP1Q9Y679 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AUP1Q9Y679 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AUP1Q9Y679 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AUP1Q9Y679 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AUP1Q9Y679 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AUP1Q9Y679 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AUP1Q9Y679 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AUP1Q9Y679 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AUP1Q9Y679 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AUP1Q9Y679 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AUP1Q9Y679 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AUP1Q9Y679 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AUP1Q9Y679 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AUP1Q9Y679 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AUP1Q9Y679 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AUP1Q9Y679 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AUP1Q9Y679 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
AUP1Q9Y679 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AUP1Q9Y679 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AUP1Q9Y679 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
AUP1Q9Y679 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AUP1Q9Y679 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
AUP1Q9Y679 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AUP1Q9Y679 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AUP1Q9Y679 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AUP1Q9Y679 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AUP1Q9Y679 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AUP1Q9Y679 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AUP1Q9Y679 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AUP1Q9Y679 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AUP1Q9Y679 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AUP1Q9Y679 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AUP1Q9Y679 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AUP1Q9Y679 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AUP1Q9Y679 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AUP1Q9Y679 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AUP1Q9Y679 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AUP1Q9Y679 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AUP1Q9Y679 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AUP1Q9Y679 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
AUP1Q9Y679 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AUP1Q9Y679 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AUP1Q9Y679 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AUP1Q9Y679 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AUP1Q9Y679 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AUP1Q9Y679 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AUP1Q9Y679 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AUP1Q9Y679 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AUP1Q9Y679 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AUP1Q9Y679 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AUP1Q9Y679 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms