Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms