Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DTX4Q9Y2E6 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
DTX4Q9Y2E6 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
DTX4Q9Y2E6 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DTX4Q9Y2E6 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DTX4Q9Y2E6 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DTX4Q9Y2E6 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DTX4Q9Y2E6 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DTX4Q9Y2E6 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DTX4Q9Y2E6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DTX4Q9Y2E6 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DTX4Q9Y2E6 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DTX4Q9Y2E6 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DTX4Q9Y2E6 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DTX4Q9Y2E6 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DTX4Q9Y2E6 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DTX4Q9Y2E6 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DTX4Q9Y2E6 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DTX4Q9Y2E6 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DTX4Q9Y2E6 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DTX4Q9Y2E6 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DTX4Q9Y2E6 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DTX4Q9Y2E6 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DTX4Q9Y2E6 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DTX4Q9Y2E6 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DTX4Q9Y2E6 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DTX4Q9Y2E6 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DTX4Q9Y2E6 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DTX4Q9Y2E6 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DTX4Q9Y2E6 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DTX4Q9Y2E6 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DTX4Q9Y2E6 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DTX4Q9Y2E6 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DTX4Q9Y2E6 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DTX4Q9Y2E6 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DTX4Q9Y2E6 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DTX4Q9Y2E6 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DTX4Q9Y2E6 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DTX4Q9Y2E6 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DTX4Q9Y2E6 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DTX4Q9Y2E6 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DTX4Q9Y2E6 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DTX4Q9Y2E6 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DTX4Q9Y2E6 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DTX4Q9Y2E6 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DTX4Q9Y2E6 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DTX4Q9Y2E6 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DTX4Q9Y2E6 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DTX4Q9Y2E6 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DTX4Q9Y2E6 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DTX4Q9Y2E6 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DTX4Q9Y2E6 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DTX4Q9Y2E6 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DTX4Q9Y2E6 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DTX4Q9Y2E6 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DTX4Q9Y2E6 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DTX4Q9Y2E6 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DTX4Q9Y2E6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DTX4Q9Y2E6 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DTX4Q9Y2E6 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DTX4Q9Y2E6 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DTX4Q9Y2E6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DTX4Q9Y2E6 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DTX4Q9Y2E6 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DTX4Q9Y2E6 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DTX4Q9Y2E6 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DTX4Q9Y2E6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DTX4Q9Y2E6 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DTX4Q9Y2E6 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DTX4Q9Y2E6 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DTX4Q9Y2E6 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms