Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms