Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SHANK2Q9UPX8 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SHANK2Q9UPX8 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SHANK2Q9UPX8 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SHANK2Q9UPX8 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SHANK2Q9UPX8 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SHANK2Q9UPX8 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SHANK2Q9UPX8 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
SHANK2Q9UPX8 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SHANK2Q9UPX8 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SHANK2Q9UPX8 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SHANK2Q9UPX8 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SHANK2Q9UPX8 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SHANK2Q9UPX8 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SHANK2Q9UPX8 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms