Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
L1RE1Q9UN81 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
L1RE1Q9UN81 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
L1RE1Q9UN81 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
L1RE1Q9UN81 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
L1RE1Q9UN81 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
L1RE1Q9UN81 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
L1RE1Q9UN81 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
L1RE1Q9UN81 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
L1RE1Q9UN81 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
L1RE1Q9UN81 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
L1RE1Q9UN81 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
L1RE1Q9UN81 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
L1RE1Q9UN81 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
L1RE1Q9UN81 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
L1RE1Q9UN81 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
L1RE1Q9UN81 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
L1RE1Q9UN81 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
L1RE1Q9UN81 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
L1RE1Q9UN81 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
L1RE1Q9UN81 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
L1RE1Q9UN81 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
L1RE1Q9UN81 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
L1RE1Q9UN81 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
L1RE1Q9UN81 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
L1RE1Q9UN81 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
L1RE1Q9UN81 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
L1RE1Q9UN81 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
L1RE1Q9UN81 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
L1RE1Q9UN81 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
L1RE1Q9UN81 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
L1RE1Q9UN81 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
L1RE1Q9UN81 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
L1RE1Q9UN81 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
L1RE1Q9UN81 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
L1RE1Q9UN81 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
L1RE1Q9UN81 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
L1RE1Q9UN81 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
L1RE1Q9UN81 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
L1RE1Q9UN81 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
L1RE1Q9UN81 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
L1RE1Q9UN81 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
L1RE1Q9UN81 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
L1RE1Q9UN81 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
L1RE1Q9UN81 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
L1RE1Q9UN81 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
L1RE1Q9UN81 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
L1RE1Q9UN81 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
L1RE1Q9UN81 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
L1RE1Q9UN81 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
L1RE1Q9UN81 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
L1RE1Q9UN81 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
L1RE1Q9UN81 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
L1RE1Q9UN81 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
L1RE1Q9UN81 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
L1RE1Q9UN81 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
L1RE1Q9UN81 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
L1RE1Q9UN81 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
L1RE1Q9UN81 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
L1RE1Q9UN81 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21■□□□□ 0.95
L1RE1Q9UN81 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21■□□□□ 0.95
L1RE1Q9UN81 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
L1RE1Q9UN81 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
L1RE1Q9UN81 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
L1RE1Q9UN81 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
L1RE1Q9UN81 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
L1RE1Q9UN81 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
L1RE1Q9UN81 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
L1RE1Q9UN81 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
L1RE1Q9UN81 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
L1RE1Q9UN81 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
L1RE1Q9UN81 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
L1RE1Q9UN81 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
L1RE1Q9UN81 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
L1RE1Q9UN81 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
L1RE1Q9UN81 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
L1RE1Q9UN81 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
L1RE1Q9UN81 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
L1RE1Q9UN81 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
L1RE1Q9UN81 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
L1RE1Q9UN81 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
L1RE1Q9UN81 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
L1RE1Q9UN81 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
L1RE1Q9UN81 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
L1RE1Q9UN81 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
L1RE1Q9UN81 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
L1RE1Q9UN81 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
L1RE1Q9UN81 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
L1RE1Q9UN81 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
L1RE1Q9UN81 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
L1RE1Q9UN81 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
L1RE1Q9UN81 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
L1RE1Q9UN81 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
L1RE1Q9UN81 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
L1RE1Q9UN81 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
L1RE1Q9UN81 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
L1RE1Q9UN81 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
L1RE1Q9UN81 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
L1RE1Q9UN81 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
L1RE1Q9UN81 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms