Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms