Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms