Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
INO80Q9ULG1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
INO80Q9ULG1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
INO80Q9ULG1 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
INO80Q9ULG1 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
INO80Q9ULG1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
INO80Q9ULG1 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
INO80Q9ULG1 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
INO80Q9ULG1 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
INO80Q9ULG1 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
INO80Q9ULG1 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
INO80Q9ULG1 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
INO80Q9ULG1 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
INO80Q9ULG1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
INO80Q9ULG1 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
INO80Q9ULG1 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
INO80Q9ULG1 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
INO80Q9ULG1 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
INO80Q9ULG1 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
INO80Q9ULG1 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
INO80Q9ULG1 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
INO80Q9ULG1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
INO80Q9ULG1 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
INO80Q9ULG1 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
INO80Q9ULG1 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
INO80Q9ULG1 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
INO80Q9ULG1 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
INO80Q9ULG1 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
INO80Q9ULG1 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
INO80Q9ULG1 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
INO80Q9ULG1 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
INO80Q9ULG1 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
INO80Q9ULG1 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
INO80Q9ULG1 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
INO80Q9ULG1 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
INO80Q9ULG1 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
INO80Q9ULG1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
INO80Q9ULG1 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
INO80Q9ULG1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
INO80Q9ULG1 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
INO80Q9ULG1 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
INO80Q9ULG1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
INO80Q9ULG1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
INO80Q9ULG1 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
INO80Q9ULG1 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
INO80Q9ULG1 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
INO80Q9ULG1 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
INO80Q9ULG1 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
INO80Q9ULG1 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
INO80Q9ULG1 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
INO80Q9ULG1 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
INO80Q9ULG1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
INO80Q9ULG1 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
INO80Q9ULG1 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
INO80Q9ULG1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
INO80Q9ULG1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
INO80Q9ULG1 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
INO80Q9ULG1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
INO80Q9ULG1 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
INO80Q9ULG1 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
INO80Q9ULG1 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
INO80Q9ULG1 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
INO80Q9ULG1 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
INO80Q9ULG1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
INO80Q9ULG1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
INO80Q9ULG1 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
INO80Q9ULG1 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
INO80Q9ULG1 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
INO80Q9ULG1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
INO80Q9ULG1 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
INO80Q9ULG1 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
INO80Q9ULG1 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
INO80Q9ULG1 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
INO80Q9ULG1 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
INO80Q9ULG1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
INO80Q9ULG1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
INO80Q9ULG1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
INO80Q9ULG1 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
INO80Q9ULG1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
INO80Q9ULG1 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
INO80Q9ULG1 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
INO80Q9ULG1 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
INO80Q9ULG1 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
INO80Q9ULG1 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
INO80Q9ULG1 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
INO80Q9ULG1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
INO80Q9ULG1 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
INO80Q9ULG1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
INO80Q9ULG1 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
INO80Q9ULG1 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
INO80Q9ULG1 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
INO80Q9ULG1 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
INO80Q9ULG1 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
INO80Q9ULG1 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
INO80Q9ULG1 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
INO80Q9ULG1 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
INO80Q9ULG1 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
INO80Q9ULG1 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
INO80Q9ULG1 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
INO80Q9ULG1 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms