Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms