Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX3

MYH13, Myosin-13, humanhuman

Predictions only

Length 1,938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH13Q9UKX3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms