Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms