Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms