Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms