Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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