Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms