Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
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