Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI2

KCNIP1, Kv channel-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP1Q9NZI2 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms