Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
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