Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
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TMOD3Q9NYL9 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
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