Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY27

PPP4R2, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R2Q9NY27 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPP4R2Q9NY27 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPP4R2Q9NY27 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPP4R2Q9NY27 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPP4R2Q9NY27 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms