Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms