Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms