Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT99

LRRC4B, Leucine-rich repeat-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4BQ9NT99 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms