Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EMILIN3Q9NT22 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms