Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms