Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF2

SH2B1, SH2B adapter protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2B1Q9NRF2 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms