Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQY0

BIN3, Bridging integrator 3, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIN3Q9NQY0 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms