Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms