Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms