Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms