Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNZ6

PRM3, Protamine-3, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM3Q9NNZ6 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRM3Q9NNZ6 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRM3Q9NNZ6 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRM3Q9NNZ6 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PRM3Q9NNZ6 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PRM3Q9NNZ6 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PRM3Q9NNZ6 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PRM3Q9NNZ6 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PRM3Q9NNZ6 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PRM3Q9NNZ6 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PRM3Q9NNZ6 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PRM3Q9NNZ6 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PRM3Q9NNZ6 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PRM3Q9NNZ6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms