Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX1

TUFT1, Tuftelin, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFT1Q9NNX1 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TUFT1Q9NNX1 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUFT1Q9NNX1 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUFT1Q9NNX1 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUFT1Q9NNX1 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUFT1Q9NNX1 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUFT1Q9NNX1 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUFT1Q9NNX1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUFT1Q9NNX1 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUFT1Q9NNX1 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUFT1Q9NNX1 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUFT1Q9NNX1 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUFT1Q9NNX1 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUFT1Q9NNX1 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUFT1Q9NNX1 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUFT1Q9NNX1 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUFT1Q9NNX1 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUFT1Q9NNX1 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUFT1Q9NNX1 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TUFT1Q9NNX1 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TUFT1Q9NNX1 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUFT1Q9NNX1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUFT1Q9NNX1 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUFT1Q9NNX1 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUFT1Q9NNX1 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUFT1Q9NNX1 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUFT1Q9NNX1 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUFT1Q9NNX1 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUFT1Q9NNX1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUFT1Q9NNX1 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUFT1Q9NNX1 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUFT1Q9NNX1 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUFT1Q9NNX1 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUFT1Q9NNX1 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUFT1Q9NNX1 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUFT1Q9NNX1 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUFT1Q9NNX1 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUFT1Q9NNX1 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUFT1Q9NNX1 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TUFT1Q9NNX1 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUFT1Q9NNX1 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TUFT1Q9NNX1 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUFT1Q9NNX1 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUFT1Q9NNX1 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUFT1Q9NNX1 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUFT1Q9NNX1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUFT1Q9NNX1 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUFT1Q9NNX1 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUFT1Q9NNX1 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUFT1Q9NNX1 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUFT1Q9NNX1 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUFT1Q9NNX1 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUFT1Q9NNX1 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TUFT1Q9NNX1 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUFT1Q9NNX1 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUFT1Q9NNX1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUFT1Q9NNX1 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUFT1Q9NNX1 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUFT1Q9NNX1 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUFT1Q9NNX1 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUFT1Q9NNX1 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUFT1Q9NNX1 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUFT1Q9NNX1 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUFT1Q9NNX1 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TUFT1Q9NNX1 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUFT1Q9NNX1 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUFT1Q9NNX1 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TUFT1Q9NNX1 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUFT1Q9NNX1 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUFT1Q9NNX1 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUFT1Q9NNX1 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUFT1Q9NNX1 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUFT1Q9NNX1 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUFT1Q9NNX1 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUFT1Q9NNX1 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUFT1Q9NNX1 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUFT1Q9NNX1 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TUFT1Q9NNX1 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TUFT1Q9NNX1 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TUFT1Q9NNX1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TUFT1Q9NNX1 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TUFT1Q9NNX1 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TUFT1Q9NNX1 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms