Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms