Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms