Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms