Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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FOXQ1Q9C009 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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FOXQ1Q9C009 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
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FOXQ1Q9C009 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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FOXQ1Q9C009 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
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FOXQ1Q9C009 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
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FOXQ1Q9C009 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
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