Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms