Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms