Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms