Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 Metazoa_SRP.67-201ENST00000617099 296 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms