Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERPUD2Q9BSE4 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms