Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms