Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms