Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms