Protein–RNA interactions for Protein: Q99766

ATP5S, ATP synthase subunit s, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5SQ99766 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms