Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD5Q99717 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD5Q99717 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD5Q99717 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD5Q99717 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD5Q99717 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD5Q99717 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD5Q99717 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD5Q99717 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD5Q99717 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD5Q99717 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD5Q99717 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD5Q99717 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD5Q99717 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD5Q99717 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD5Q99717 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD5Q99717 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD5Q99717 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD5Q99717 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD5Q99717 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD5Q99717 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD5Q99717 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD5Q99717 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD5Q99717 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD5Q99717 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD5Q99717 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD5Q99717 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD5Q99717 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD5Q99717 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD5Q99717 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD5Q99717 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD5Q99717 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD5Q99717 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD5Q99717 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD5Q99717 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD5Q99717 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD5Q99717 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD5Q99717 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD5Q99717 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD5Q99717 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD5Q99717 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD5Q99717 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD5Q99717 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD5Q99717 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD5Q99717 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD5Q99717 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD5Q99717 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD5Q99717 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD5Q99717 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD5Q99717 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD5Q99717 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD5Q99717 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD5Q99717 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD5Q99717 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD5Q99717 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD5Q99717 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD5Q99717 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD5Q99717 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD5Q99717 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD5Q99717 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SMAD5Q99717 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SMAD5Q99717 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD5Q99717 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD5Q99717 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD5Q99717 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD5Q99717 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD5Q99717 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD5Q99717 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD5Q99717 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD5Q99717 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD5Q99717 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD5Q99717 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD5Q99717 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD5Q99717 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD5Q99717 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD5Q99717 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD5Q99717 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD5Q99717 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD5Q99717 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD5Q99717 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD5Q99717 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD5Q99717 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD5Q99717 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD5Q99717 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD5Q99717 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD5Q99717 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD5Q99717 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD5Q99717 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD5Q99717 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMAD5Q99717 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMAD5Q99717 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMAD5Q99717 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SMAD5Q99717 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMAD5Q99717 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SMAD5Q99717 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMAD5Q99717 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMAD5Q99717 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMAD5Q99717 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMAD5Q99717 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMAD5Q99717 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms