Protein–RNA interactions for Protein: Q99496

RNF2, E3 ubiquitin-protein ligase RING2, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF2Q99496 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RNF2Q99496 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RNF2Q99496 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms