Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TCF12Q99081 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TCF12Q99081 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TCF12Q99081 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TCF12Q99081 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TCF12Q99081 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TCF12Q99081 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TCF12Q99081 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TCF12Q99081 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TCF12Q99081 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TCF12Q99081 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TCF12Q99081 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TCF12Q99081 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TCF12Q99081 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TCF12Q99081 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TCF12Q99081 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TCF12Q99081 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TCF12Q99081 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TCF12Q99081 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TCF12Q99081 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TCF12Q99081 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TCF12Q99081 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TCF12Q99081 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TCF12Q99081 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TCF12Q99081 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TCF12Q99081 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TCF12Q99081 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TCF12Q99081 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TCF12Q99081 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TCF12Q99081 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TCF12Q99081 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TCF12Q99081 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TCF12Q99081 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TCF12Q99081 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TCF12Q99081 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TCF12Q99081 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TCF12Q99081 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TCF12Q99081 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TCF12Q99081 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TCF12Q99081 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TCF12Q99081 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TCF12Q99081 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TCF12Q99081 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TCF12Q99081 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TCF12Q99081 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TCF12Q99081 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TCF12Q99081 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TCF12Q99081 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TCF12Q99081 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TCF12Q99081 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TCF12Q99081 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TCF12Q99081 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TCF12Q99081 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TCF12Q99081 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TCF12Q99081 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TCF12Q99081 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TCF12Q99081 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TCF12Q99081 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TCF12Q99081 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TCF12Q99081 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TCF12Q99081 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TCF12Q99081 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TCF12Q99081 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TCF12Q99081 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TCF12Q99081 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TCF12Q99081 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TCF12Q99081 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TCF12Q99081 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TCF12Q99081 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TCF12Q99081 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TCF12Q99081 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TCF12Q99081 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TCF12Q99081 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TCF12Q99081 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TCF12Q99081 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TCF12Q99081 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TCF12Q99081 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TCF12Q99081 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TCF12Q99081 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TCF12Q99081 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TCF12Q99081 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TCF12Q99081 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TCF12Q99081 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TCF12Q99081 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TCF12Q99081 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TCF12Q99081 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TCF12Q99081 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TCF12Q99081 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TCF12Q99081 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TCF12Q99081 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TCF12Q99081 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TCF12Q99081 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TCF12Q99081 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TCF12Q99081 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TCF12Q99081 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TCF12Q99081 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TCF12Q99081 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TCF12Q99081 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TCF12Q99081 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TCF12Q99081 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms