Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DCLRE1CQ96SD1 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms